Applied Biosystems™ TaqMan™ Copy Number Reference Assay, mouse, Tfrc

Descripción

Los ensayos de referencia de número de copias TaqMan™ de ratón se utilizan con los ensayos de número de copias TaqMan™ personalizados, personalizados Plus y prediseñados en una reacción de PCR en tiempo real dúplex para detectar y medir las variaciones de número de copias en el genoma de ratón. Los ensayos de referencia de número de copias TaqMan™ de ratón también son compatibles con los ensayos de número de copias TaqMan™ prediseñados de marcadores vectoriales comunes y genes informantes. Se ofrecen dos opciones de genes que se pueden utilizar como genes de referencia endógena en ratones: Tfrc y Tert. Los ensayos de referencia de número de copias TaqMan™ se han diseñado para secuencias genómicas únicas en el conjunto de genoma de referencia de ratón (NCBI versión 37/mm9) y son necesarios para la cuantificación relativa de los objetivos de número de copias.

Los ensayos de número de copias TaqMan™ cuantifican el gen de interés y lo normalizan en un gen endógeno que se sabe que está presente en dos copias de un genoma diploide. Tenga en cuenta que los ensayos de referencia de número de copias TaqMan™ son específicos de la especie.

Tfrc: La opción de gen de referencia estándar
Los ensayos de referencia de número de copias TaqMan™ tienen una sonda TAMRA™ marcada con tinte VIC™ y primers de avance y retroceso específicos de la secuencia de referencia. Los ensayos no se limitan al primer.

El ensayo de referencia de número de copias TaqMan™, ratón, Tfrc se recomienda como el ensayo de referencia estándar para el análisis del número de copias en ratones. Este ensayo detecta el gen receptor de transferrina (Tfrc) en el cromosoma 16, citobanda 16qB3. La ubicación del ensayo es chr.16:32626732 en NCBI versión 37. Tiene un amplicón de 91 bp que se mapea dentro del exón 17 del gen Tfrc.

El ensayo de referencia de número de copias TaqMan™, ratón, Tert es un ensayo de referencia alternativo; se recomienda en caso de que el ensayo de Tfrc funcione mal con una muestra debido a aberraciones cromosómicas u otros problemas. Este ensayo detecta el gen de la transcriptasa inversa de la telomerasa (Tert) en el cromosoma 13, citobanda 13qC1. La ubicación del ensayo es chr.13:73778992 en NCBI versión 37. Tiene un amplicón de 96 bp que se mapea dentro del intrón 8 del gen Tert.

Flujo de trabajo más sencillo disponible
Los ensayos de número de copias TaqMan™ tienen el flujo de trabajo más sencillo de todos los métodos de análisis CNV disponibles actualmente. El ensayo de análisis (marcado con tinte FAM™), el ensayo de referencia (marcado con tinte VIC™), su muestra de ADN y la mezcla maestra TaqMan™ se combinan y posteriormente se procesan en un sistema de PCR en tiempo real Applied Biosystems™ utilizando el protocolo estándar de ensayo de número de copias TaqMan™. En promedio, la configuración del análisis primario solo tarda 3-4 horas (incluyendo una secuencia de PCR de aproximadamente 2 horas).

Potente software de análisis de datos
El software CopyCaller™ se desarrolló específicamente para el análisis de datos de ensayo de número de copias TaqMan™. Este software gratuito y fácil de usar utiliza una interfaz gráfica que calcula rápidamente los números de copias posibles para un conjunto de muestras en un ciclo. También ofrece un valor de confianza para cada llamada al número de copias y tiene funcionalidad de valores atípicos.

Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso diagnóstico o terapéutico en humanos ni en animales.