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OPTIZYME™ AloI, Fisher BioReagents™

Código de producto. 11994822
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Código de producto. 11994822 Proveedor Fisher BioReagents N.º de proveedor BP80751
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5'...^ 7(N) G A A C (N)6 T C C (N)12-13^...3'
3'...^12-13(N) C T T G (N)6 A G G (N)7 ^...5'

Suministrado con: Tampón 5 OPTIZYME 10X
Condiciones para el 100 % de actividad:

  • 1 tampón OPTIZYME 5: 10 mM de Tris-HCl (pH 8,5 a 37 °C), 10 mM de MgCl2, 100 mM de KCl y 0,1 mg/ml de BSA
  • Incube a 30°C
Actividad enzimática en los tampones OPTIZYME:
  • Tampón 1: 0 - 20 %
  • Tampón 2: 0 - 20 %
  • Tampón 3: 0 - 20 %
  • Tampón 4: 20 - 50 %
  • Tampón 5: 100 %
Tampón de almacenamiento:
  • 10 mm de Tris-HCl (pH de 7,4 a 25°C), 100 mm de KCl, 1 mm de DTT, 1 mm de EDTA, 0,2 mg/ml de BSA y 50 % (v/v) de glicerol
  • Ligadura y reescisión:
  • Aproximadamente el 70 % de los fragmentos de ADN pueden ligarse y más del 80 % de ellos pueden volver a cortarse después de una sobredigestión con 10 veces la cantidad recomendada de AloI.
  • Notas:
    • La incubación a 37°C resulta en un 20 % de actividad.
    • AloI produce cortes bicatenarios en ambos lados del punto de reconocimiento interrumpido. Su única característica es un punto de escisión degenerado en el extremo 3 de la secuencia de reconocimiento (a 12 o 13 nucleótidos de distancia).
    • La presencia de S-adenosilmetionina en la mezcla de reacción produce una fragmentación incompleta con AloI.
    • Una sobredigestión con 10 veces la cantidad recomendada de AloI puede provocar una actividad estrella (star activity).
    • Alol puede permanecer asociada al ADN fragmentado, lo que puede provocar un desplazamiento de las bandas de ADN durante la electroforesis. Para evitar patrones atípicos de las bandas de ADN, use colorante de carga de ADN 6X & solución de SDS para la preparación de muestras o caliente el ADN digerido en presencia de SDS antes de la electroforesis.
    Efectos de la metilación:
    Dam: puede solaparse (efecto sin determinar)
    • 5'...GAAC(N)4Gm6A TCC...3'
  • 3'...CTTG(N)4C Tm6AGG...5'
  • (No se ha determinado el efecto en la escisión)
  • Dcm: puede solaparse (sin efecto)
    • 5'...GAAC(N)6TCm5CW GG...3'
  • 3'...CTTG(N)6AG GWm5CC...5'
  • (Sin efecto sobre la escisión)
  • CpG: Puede solaparse (escisión alterada)
    • 5'...m5C GAAC(N)6TCC...3'
  • 3'... Gm5CTTG(N)6AGG...5'
  • (La escisión está bloqueada)
    • 5'...GAAC(N)6TCm5C G...3'
  • 3'...CTTG(N)6AG Gm5C...5'
  • (Sin efecto sobre la escisión)
    • 5'...GAAm5C G(N)5TCC...3'
  • 3'...CTT Gm5C(N)5AGG...5'
  • (Sin efecto sobre la escisión)
  • EcoKI: nunca se solapa; ningún efecto.
  • EcoBI: nunca se solapa; ningún efecto.
  • TRUSTED_SUSTAINABILITY

    Especificaciones

    Concentración De 1 a 3 U/μl
    Componentes De 25 a 50 % de agua, >50 % de glicerina
    Temperatura de la incubadora 30 °C
    pH 7,4
    Para utilizar con (aplicación) >95 % de los fragmentos de ADN pueden ligarse y volver a cortarse después de una sobredigestión con 50 veces la cantidad recomendada de AloI.
    Tampón de almacenamiento 10 mM de Tris HCl (pH 7,4 a 25 °C), 100 mM de KCl, 1 mM de DTT, 1 mM de EDTA, 0,2 mg/ml de BSA, glicerol al 50 %
    Contenido y almacenamiento Mantener el contenedor bien cerrado
    Cantidad 100 U
    Sitio de corte (7/12)GAAC(N)6TCC(12/7)
    Tipo de producto AloI
    Formulario Líquido
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    Título del producto
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