Ambion™ Mezcla de sustancia añadida de ARN de ERCC

La variación de datos en la expresión de ARN se puede atribuir a una serie de factores, incluida la calidad del material de partida, el nivel de celularidad y producción de ARN, la plataforma empleada y la persona que realiza en experimento. Para controlar estas fuentes de variabilidad, el Consorcio de Controles Externos de ARN (ERCC), un grupo ad hoc de organizaciones académicas, privadas y públicas organizadas por el Instituto Nacional de Estándares y Tecnología, ha desarrollado un conjunto común de controles externos de ARN. (NIST ). Los controles constan de un conjunto de transcritos poliadenilados y sin marcar diseñados para añadir a los experimentos de análisis de ARN tras el aislamiento de la muestra para compararlas con un conjunto de criterios de rendimiento. Antes del diseño de estos controles universalmente aceptados resultaba difícil ejecutar una investigación exhaustiva de métricas fundamentales de rendimiento analítico. De la marca de confianza de reactivos de ARN de calidad, Ambion™ Las mezclas de control ERCC Spike-In son mezclas preformuladas disponibles comercialmente de 92 transcritos, derivados y trazables a partir de plásmidos de ADN certificados por el NIST. Los transcritos están diseñados para tener una longitud de 250 a 2000 nt, lo que imita a los ARNm eucariotas naturales.

Características principales del producto:

Lograr una medida estándar para la comparación de datos entre experimentos de expresión génica

Medir la sensibilidad (límite inferior de detección) y el rango dinámico de un experimento

Cuantificar la expresión génica diferencial

Libere el potencial del análisis de ARN
El análisis del ARN, incluido el perfil de expresión génica y el estudio del transcriptoma completo, puede conducir a una mejor comprensión de los patrones de expresión en estados patológicos y proporciona una mayor comprensión de las vías biológicas y los mecanismos moleculares que regulan el destino celular, el desarrollo y la progresión de la enfermedad. Los métodos tradicionales para el análisis de ARN, como la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) y los microarreglos, tienen una eficacia demostrada. En la actualidad, los sustituye la secuenciación de última generación, una alternativa digital de gran rendimiento. Debido a que cada método utiliza múltiples plataformas, y con la necesidad de comparar varias muestras a través de plataformas en todo el mundo, una medida estándar para la comparación de datos es necesaria. A medida que se amplíen las capacidades del análisis del ARN, la necesidad de crear una vista estandarizada de los datos será aún más importante.

Obtener y comparar resultados con exactitud confirmada
Ambion™ Los controles de adición de ARN del ERCC se utilizan para crear una medición basal estándar del ARN tanto dentro de un experimento como en varios experimentos realizados con diversas muestras y plataformas. Gracias a las dos formulaciones de mezcla de sustancia añadida (figura 1), se pueden examinar varias mediciones, como la sensibilidad y el rango dinámico, para evaluar los distintos parámetros en un experimento o varios (figura 2). Además, las relaciones de cambio de expresión entre dos muestras se pueden calcular con un alto grado de confianza mediante la relación altamente concordante entre la sustancia añadida de ARN ExFold 1 y la sustancia añadida de ARN ExFold 2 (figura 3). Las mediciones se determinaron a través de concentraciones molares conocidas para cada transcripción dentro de spike-in mix y a través de asociación de las dos mezclas utilizando una combinación de relaciones a través de 4 subgrupos diferentes de los 92 transcritos. Los controles son ideales para experimentos de secuenciación de próxima generación, como en SOLiD™ y las plataformas de microarrays compatibles, como el Illumina™ Sentrix™ BeadChip.

Elija entre opciones flexibles para las configuraciones del kit de CPRE
Ya sea para medir el rango dinámico o el cambio en la expresión génica, Ambion™ Las mezclas de control de ERCC Spike-In están disponibles en dos configuraciones de kit para satisfacer sus necesidades experimentales. Utilice la mezcla de control de sustancia añadida de ERCC para determinar el rango dinámico y el límite inferior de detección de la plataforma. Utilice las mezclas de sustancias añadidas de ERCC ExFold para evaluar la precisión de las mediciones de expresión génica diferencial.

	Mezcla 1 de adición de ARN de CPRE*	ExFold Spike-In Mix 1*	ExFold Spike-In Mix 2*	Agua libre de nucleasas
Mezcla de adición de ARN para CPRE (n.º de cat. 4456740)	10 μL	—	—	1,75 mL
ERCC ExFold RNA Spike-In Mixes (n.º de cat. 4456739)	—	10 μL	10 μL	1,75 mL

*Aunque la mezcla 1 de la adición de ARN para ERCC y la mezcla 1 de la adición de ExFold contienen la misma formulación de transcritos de ERCC, no sustituya la mezcla 1 de la adición de ARN de las ERCC por la mezcla 1 de la adición de ExFold para la evaluación del cambio de pliegue. Utilice solo ExFold Spike-In Mix 1 y Mix 2 con el mismo número de lote de fabricación.

Solo para uso en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.