Thermo Scientific™ aminoxyTMTsixplex™ Label Reagent Set

Descripción

Realice un caracterización y cuantificación multiplexadas de biomoléculas que contienen carbonilo (carbohidratos, esteroides y proteínas oxidadas) mediante espectrometría de masas (MS) con los reactivos de marcado Thermo Scientific™ aminoxyTMT (Tandem Mass Tag) reactivos al carbonilo.

Los reactivos de marcado Thermo Scientific™ aminoxyTMT™ (Tandem Mass Tag™) reactivos al carbonilo permiten la caracterización y cuantificación multiplexadas de biomoléculas que contienen carbonilo (carbohidratos, esteroides y proteínas oxidadas) mediante espectrometría de masas (MS).

Los seis compuestos del juego de reactivos aminoxyTMTsixplex™ tienen la misma masa (isobárica) y estructura química (grupo aminoxi reactivo al carbonilo, brazo separador e indicador de masas). Sin embargo, la distribución específica de isótopos 13C y 15N a cada lado del sitio de fragmentación de MS/MS de HCD o ETD en cada reactivo da como resultado una masa indicadora única (126-131Da) en la región de masa baja. Este conjunto de iones indicadores se utiliza para medir la abundancia relativa de moléculas marcadas en una muestra de MS combinada (multiplexada) que representa seis condiciones de tratamiento diferentes. Para las aplicaciones de MS de glicobiología, los reactivos permiten el perfilado cuantitativo de isoformas de glicanos y el descubrimiento de biomarcadores de glicanos; proporcionan una mejor ionización de los glicanos marcados para lograr una mayor sensibilidad y una mejor retención de los glicanos marcados mediante cromatografía líquida de fase reversa (RPLC). Los reactivos aminoxyTMT pueden usarse para cuantificar una amplia gama de moléculas biológicamente importantes, incluidos carbohidratos, esteroides o proteínas oxidadas.

• Cuantitativo: permite la cuantificación relativa de glicanos u otras biomoléculas que contienen carbonilo a partir de múltiples muestras derivadas de células, tejidos o fluidos biológicos
• Estable: el enlace de oxima y los productos formados por la reacción de marcado son estables y no requieren un paso de reducción adicional
• Eficaz: logre una eficacia de marcado superior al 90 % en una hora
• Sensible: aumento en 20 veces de la relación señal-ruido en comparación con el análisis de MS de glicanos nativos sin marcar
• Multiplexado: capaz de identificar y caracterizar hasta seis muestras simultáneamente
• Optimizado: procedimientos y reactivos optimizados para una excelente eficacia de marcado y recuperación de glicanos

• Los juegos de reactivos de marcado contienen suficientes etiquetas aminoxyTMT para marcar 6 muestras de control (n.º de ref. 90400), un experimento de seis complejos (n.º de ref. 90401) o cinco experimentos de seis complejos (n.º de ref. 90402)

• Columnas HLB de PNGasa F (o PNGasa A) glicosidasa y Waters Oasis™

• Multiplexe hasta 6 muestras diferentes simultáneamente en un solo experimento
• Cuantificación relativa de glicanos
• Estudio de la diversidad estructural de la glicosilación de proteínas
• Estudio de la glicosilación en la señalización y regulación celulares
• Estudio de la progresión del cáncer, el descubrimiento de biomarcadores y el análisis de bioterapias

Los glicanos nativos son difíciles de estudiar mediante espectrometría de masas debido a su baja eficiencia de ionización. La cuantificación de los glicanos es particularmente difícil debido a la falta de estándares para todos los glicanos naturales y a las dificultades para cuantificar de forma reproducible múltiples muestras. El grupo aminoxi tiene mejor reactividad con los carbonilos y mejor estabilidad del producto marcado en comparación con las hidrozidas. El marcado con los reactivos aminoxyTMT mejora la ionización de los glicanos, lo que mejora la sensibilidad y permite la cuantificación relativa de los glicanos para hasta seis muestras simultáneamente.

El reactivo de marcado aminoxyTMTzero™ no contiene isótopos pesados y se puede utilizar para evaluar el reactivo en diferentes flujos de trabajo. Los reactivos de marcado aminoxyTMTsixplex comparten una estructura idéntica con el reactivo aminoxyTMTzero, pero contienen diferentes números y combinaciones de isótopos 13C y 15N en el indicador de masas. El procedimiento de marcado optimizado se puede realizar en una hora. Después del marcado de etiquetas, las muestras se absorben y se limpian mediante la extracción en fase sólida HILIC antes del análisis de espectrometría de masas.